More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0455 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0455  putative geranyltranstransferase  100 
 
 
267 aa  539  9.999999999999999e-153  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.765692  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0567  farnesyl-diphosphate synthase  85.39 
 
 
283 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  37.68 
 
 
305 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  36.26 
 
 
308 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  39.23 
 
 
307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  34.96 
 
 
296 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  41.03 
 
 
300 aa  179  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  36.84 
 
 
294 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  37.22 
 
 
303 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  37.02 
 
 
308 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  39.18 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  36.54 
 
 
308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  36.3 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  35.76 
 
 
297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  35.16 
 
 
321 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  35.11 
 
 
307 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_002978  WD1192  geranyltranstransferase  53.47 
 
 
335 aa  171  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  36.78 
 
 
308 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  43.4 
 
 
297 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  33.8 
 
 
299 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  35.21 
 
 
295 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  39.23 
 
 
290 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  36.12 
 
 
291 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  35.21 
 
 
295 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 
293 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  36.36 
 
 
293 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 
293 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 
293 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  34.51 
 
 
294 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  36.73 
 
 
293 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  35.36 
 
 
291 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  33.96 
 
 
295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  38.06 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  38.17 
 
 
309 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  37.45 
 
 
295 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  39.82 
 
 
297 aa  163  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  35.05 
 
 
299 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  37.59 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  36 
 
 
293 aa  162  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  38.69 
 
 
304 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  38.37 
 
 
293 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  34.75 
 
 
301 aa  161  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  35.34 
 
 
311 aa  161  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  37.59 
 
 
293 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  39.37 
 
 
297 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  33.46 
 
 
299 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  34.3 
 
 
294 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  36.68 
 
 
300 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  37.59 
 
 
301 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  35.44 
 
 
300 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  35.07 
 
 
292 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  35.27 
 
 
306 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  35.31 
 
 
297 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  34.74 
 
 
300 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  35.98 
 
 
293 aa  159  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  34.39 
 
 
299 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  34.74 
 
 
300 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  34.89 
 
 
308 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  35.45 
 
 
299 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  34.84 
 
 
296 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 
286 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  37.59 
 
 
293 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  39.11 
 
 
299 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  35.45 
 
 
299 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  41.36 
 
 
299 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  35.07 
 
 
297 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  35.68 
 
 
337 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  36.82 
 
 
293 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  36.19 
 
 
294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  34.97 
 
 
297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  34.73 
 
 
295 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  41.59 
 
 
287 aa  155  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  36.05 
 
 
293 aa  155  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  32.62 
 
 
309 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  32.62 
 
 
309 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  32.49 
 
 
294 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  34.62 
 
 
306 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  35.19 
 
 
297 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  36.5 
 
 
295 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  36.5 
 
 
295 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  31.45 
 
 
297 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  33.82 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  36.09 
 
 
298 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  33.57 
 
 
312 aa  153  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  33.57 
 
 
309 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0274  geranyltranstransferase  37.07 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  34.81 
 
 
300 aa  151  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  36.7 
 
 
295 aa  151  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  33.58 
 
 
337 aa  151  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  34.27 
 
 
297 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  31.05 
 
 
322 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  40.1 
 
 
327 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  36.43 
 
 
290 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  35.08 
 
 
298 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  35.29 
 
 
296 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  36.43 
 
 
295 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  37.55 
 
 
290 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  31.05 
 
 
322 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  31.05 
 
 
322 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2570  polyprenyl synthetase  38.46 
 
 
293 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0334175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>