More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3590 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  67.33 
 
 		 206 aa  280  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  46.8 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  46.46 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  46.31 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  48 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  47.18 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  50.28 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  46.15 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  48.72 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  42.86 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  44.12 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  45.23 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  42.71 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  43.59 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  43.07 
 
 		 202 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  43.07 
 
 		 202 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  43.07 
 
 		 202 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  44 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  43.63 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  42.72 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  48.7 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  45.05 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  46.29 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  44.44 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  43.3 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  42.78 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  43.3 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  42.27 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  42.27 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  40.3 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  44.72 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  44.22 
 
 		 198 aa  140  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  40.87 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  42.19 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  37.32 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  35.44 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  34.95 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  32.49 
 
 		 283 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  35 
 
 		 301 aa  98.6  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  31.22 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  31.09 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.36 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  38.24 
 
 		 138 aa  72  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  31.31 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.85 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  30.85 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  39.53 
 
 		 102 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  28.71 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  27.27 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  28.93 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  28.14 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  31.29 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  31.25 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  42.86 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  32.3 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  29.95 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  31.03 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  28.28 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  25.87 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  29.21 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  28.64 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  28.64 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  29.21 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  29.5 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  29.5 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  26.21 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  32.93 
 
 		 665 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  29.38 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2438  Resolvase domain protein  24.26 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000895592 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  29.08 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 192 aa  62  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  25.38 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  30.05 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.5 
 
 		 515 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  30.46 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  32.08 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  27.69 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  26.77 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  29.76 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  28.06 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  34.57 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  25.82 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  28.14 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  28.43 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  28.43 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  25.85 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  29.8 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  27.84 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  28.43 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  28.72 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>