151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2973 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 343 aa  694    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  59.18 
 
 		 343 aa  448  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  59.18 
 
 		 343 aa  441  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  60.06 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  58.89 
 
 		 343 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  63.56 
 
 		 343 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  56.61 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  54.81 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  53.35 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  54.62 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  55.91 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  53.2 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  49.56 
 
 		 343 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.33 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  51.31 
 
 		 343 aa  352  5e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.44 
 
 		 343 aa  351  8.999999999999999e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.28 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.6 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.64 
 
 		 343 aa  348  8e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  52.48 
 
 		 343 aa  347  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  51.9 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  50.44 
 
 		 339 aa  325  8.000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  49.41 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  50.73 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  45.35 
 
 		 344 aa  316  5e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.64 
 
 		 343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.73 
 
 		 342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.98 
 
 		 343 aa  298  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.64 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.22 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  42.69 
 
 		 346 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  37.2 
 
 		 598 aa  216  5.9999999999999996e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  36.5 
 
 		 545 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.26 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  33.53 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.29 
 
 		 559 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.96 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.39 
 
 		 544 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.43 
 
 		 570 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.83 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  37.61 
 
 		 525 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.54 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  34.62 
 
 		 594 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  35.17 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.14 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.63 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  36.28 
 
 		 580 aa  169  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  34.11 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  34.71 
 
 		 553 aa  169  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  31.12 
 
 		 731 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  34.02 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  31.74 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.47 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.47 
 
 		 731 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  31.44 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  30.84 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  32.13 
 
 		 331 aa  159  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  32.58 
 
 		 727 aa  156  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.27 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  31.67 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.07 
 
 		 347 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.66 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.4 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  31.99 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  30.03 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  31.05 
 
 		 558 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.41 
 
 		 332 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  29.29 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.18 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.93 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  26.97 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  30.34 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.81 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  32.25 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  27.01 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.78 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  25.81 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  28.61 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  24.61 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  28.82 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.57 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  25.29 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  28.74 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.08 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.45 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  22.94 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.47 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  29.11 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.23 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.56 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.42 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  25.44 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.49 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  26.04 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  23.84 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  24.36 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.99 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.34 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.35 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>