More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2852 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2852  response regulator receiver protein  100 
 
 
268 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1937  response regulator receiver protein  74.72 
 
 
269 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0178  response regulator receiver domain-containing protein  66.8 
 
 
272 aa  360  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0180  response regulator receiver domain-containing protein  58.27 
 
 
273 aa  317  9e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0659  diguanylate cyclase  40.4 
 
 
417 aa  223  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0149639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.77 
 
 
453 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1933  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.34 
 
 
411 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0621  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.2 
 
 
415 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03374  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  41.04 
 
 
419 aa  195  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.67607  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1193  diguanylate cyclase  38.84 
 
 
415 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
500 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0581  response regulator  39.36 
 
 
417 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000040809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2466  diguanylate cyclase  42.17 
 
 
406 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0503371  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03265  hypothetical protein  41.63 
 
 
403 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0579  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
487 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721447  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0478  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.27 
 
 
422 aa  188  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1511  response regulator receiver protein  42.68 
 
 
416 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.8 
 
 
1691 aa  185  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1723  diguanylate cyclase  40.24 
 
 
420 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2154  response regulator receiver protein  38.27 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2855  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.24 
 
 
415 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220747  hitchhiker  0.000676798 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  36.89 
 
 
414 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0462  3-deoxy-d-manno-octulosonic-acid transferase  35.92 
 
 
422 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2408  response regulator receiver protein  38.27 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2233  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.77 
 
 
428 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2407  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.65 
 
 
443 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0296488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1684  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.96 
 
 
400 aa  178  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1984  threonine dehydratase  35.1 
 
 
418 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.241676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0081  response regulator/GGDEF domain-containing protein  39.11 
 
 
419 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1795  response regulator receiver protein  36.99 
 
 
274 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00918371  hitchhiker  0.000651153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1334  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.83 
 
 
447 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2726  two component response regulator  33.73 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00466  Putative two-component system regulatory protein with GGDEF domain  35.2 
 
 
414 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.6149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2153  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.04 
 
 
443 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2323  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.24 
 
 
445 aa  165  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.123075  unclonable  0.0000172862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3346  response regulator/GGDEF domain-containing protein  36.4 
 
 
417 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2518  GGDEF domain-containing protein  38.87 
 
 
407 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.72 
 
 
526 aa  155  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 
427 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0746  response regulator/GGDEF domain-containing protein  31.45 
 
 
414 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0447686  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0671  response regulator/GGDEF domain-containing protein  31.45 
 
 
414 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0652  two component response regulator  34.16 
 
 
414 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.267728  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1356  response regulator/GGDEF domain-containing protein  30.65 
 
 
414 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4080  diguanylate cyclase  33.47 
 
 
418 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00199  response regulator/GGDEF domain protein  32.14 
 
 
426 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  41.35 
 
 
124 aa  87.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  41.35 
 
 
121 aa  86.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 
1195 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  42.31 
 
 
130 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  42.31 
 
 
130 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  41.35 
 
 
125 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  42.31 
 
 
130 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  40.18 
 
 
126 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1168 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
1155 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  38.39 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  39.42 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
1158 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
1038 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  36.28 
 
 
139 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  31.82 
 
 
1526 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 
2107 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.29 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  40.19 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.76 
 
 
1659 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 
224 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
1159 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 
1816 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  25.63 
 
 
647 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  37.27 
 
 
124 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.58 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
922 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.94 
 
 
1632 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
1954 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.43 
 
 
869 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  24.15 
 
 
1161 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 
1194 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  24.54 
 
 
1158 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  39.42 
 
 
1020 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  26.91 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  35.78 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.05 
 
 
1201 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.9 
 
 
869 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  31.62 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  26.11 
 
 
896 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1546  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
1159 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 
513 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  31.16 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
1937 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  36.07 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  31.16 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  31.16 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.7 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
944 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>