More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2154 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2154  response regulator receiver protein  100 
 
 
268 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2408  response regulator receiver protein  95.9 
 
 
276 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2726  two component response regulator  79.1 
 
 
277 aa  445  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1795  response regulator receiver protein  69.73 
 
 
274 aa  394  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00918371  hitchhiker  0.000651153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2407  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.52 
 
 
443 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0296488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2153  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.13 
 
 
443 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.94 
 
 
453 aa  192  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0581  response regulator  35.97 
 
 
417 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000040809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2852  response regulator receiver protein  38.27 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03374  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  35.06 
 
 
419 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.67607  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2855  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.7 
 
 
415 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220747  hitchhiker  0.000676798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0621  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.46 
 
 
415 aa  178  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0178  response regulator receiver domain-containing protein  35.16 
 
 
272 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
500 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1723  diguanylate cyclase  38.25 
 
 
420 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1511  response regulator receiver protein  36.76 
 
 
416 aa  175  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2233  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.28 
 
 
428 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03265  hypothetical protein  36.78 
 
 
403 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0180  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 
273 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1933  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.86 
 
 
411 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1937  response regulator receiver protein  39.27 
 
 
269 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0659  diguanylate cyclase  33.86 
 
 
417 aa  170  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0149639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1684  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.18 
 
 
400 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0081  response regulator/GGDEF domain-containing protein  36.9 
 
 
419 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1193  diguanylate cyclase  34.39 
 
 
415 aa  168  8e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0579  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
487 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721447  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3346  response regulator/GGDEF domain-containing protein  37.6 
 
 
417 aa  165  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00466  Putative two-component system regulatory protein with GGDEF domain  32.4 
 
 
414 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.6149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1691 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2466  diguanylate cyclase  37.56 
 
 
406 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0503371  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  33.2 
 
 
414 aa  156  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2518  GGDEF domain-containing protein  34.98 
 
 
407 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2323  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.46 
 
 
445 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.123075  unclonable  0.0000172862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.6 
 
 
427 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.98 
 
 
526 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0478  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.37 
 
 
422 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0462  3-deoxy-d-manno-octulosonic-acid transferase  31.87 
 
 
422 aa  149  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1984  threonine dehydratase  31.08 
 
 
418 aa  145  6e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.241676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1334  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.68 
 
 
447 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00199  response regulator/GGDEF domain protein  33.8 
 
 
426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4080  diguanylate cyclase  33.95 
 
 
418 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0652  two component response regulator  31.56 
 
 
414 aa  124  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.267728  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0746  response regulator/GGDEF domain-containing protein  29.05 
 
 
414 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0447686  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1356  response regulator/GGDEF domain-containing protein  28.63 
 
 
414 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0671  response regulator/GGDEF domain-containing protein  29.05 
 
 
414 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  33.58 
 
 
896 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
896 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
716 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  32.85 
 
 
896 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  32.85 
 
 
896 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  34.91 
 
 
121 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
826 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  32.5 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 
125 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  32.5 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  29.63 
 
 
896 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  32.5 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  35.24 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  31.39 
 
 
896 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  29.63 
 
 
896 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  33.33 
 
 
139 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  31.39 
 
 
896 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  39.85 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  29.44 
 
 
896 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  34.75 
 
 
123 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  38.35 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  41.23 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  33.33 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  37.29 
 
 
2284 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  38.05 
 
 
457 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  36.36 
 
 
457 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  36.7 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
1207 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  37.29 
 
 
2301 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 
2037 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  30.66 
 
 
896 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
1002 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.98 
 
 
337 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  35.24 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
372 aa  75.5  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  32.06 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  31.43 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3369  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0278306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  38.35 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  37.19 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2121  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
121 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317416  normal  0.525904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  39.47 
 
 
568 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  37.19 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  32.08 
 
 
124 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38278  predicted protein  35.58 
 
 
145 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449429  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
2164 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  32.56 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  34.23 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  31.47 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  32.28 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  41.35 
 
 
568 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  37.19 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  31.47 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0176  response regulator receiver protein  36.29 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  31.09 
 
 
127 aa  73.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>