More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0851 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  566  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.36 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 342 aa  75.5  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  39.18 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  36.19 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  40.23 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 1341 aa  65.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  37.37 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 143 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4585  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0477904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  24.44 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  37 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  31.31 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  37.93 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  35.54 
 
 		 140 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  38.04 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  32.97 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  34.71 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3086  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  27.94 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  38.1 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6821  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3125  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000947593  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 152 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 158 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 142 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 155 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  37.63 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 150 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  25.22 
 
 		 1370 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>