156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3344 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
335 aa  659    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  56.12 
 
 
334 aa  354  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  54.63 
 
 
328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  48.31 
 
 
335 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  49.06 
 
 
336 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  49.23 
 
 
330 aa  289  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  50.46 
 
 
332 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  45.81 
 
 
335 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  47.02 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  43.94 
 
 
332 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  44.14 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  43.73 
 
 
335 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  40.3 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  40.69 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  41.69 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  41.69 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  44.07 
 
 
316 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  38.81 
 
 
336 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  39.87 
 
 
336 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  37.8 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  42.65 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  35.09 
 
 
336 aa  195  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  37.93 
 
 
365 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  39.56 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  34.47 
 
 
336 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  34.47 
 
 
336 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  34.45 
 
 
343 aa  165  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  31.19 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  28.34 
 
 
319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  23.94 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  29.67 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.69 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1216  sodium/calcium exchanger membrane region  26.89 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  24 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.95 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.48 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.48 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.48 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.27 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  25.55 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.76 
 
 
325 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.93 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  27.27 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  21.51 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3673  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.84 
 
 
325 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.074393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3504  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.84 
 
 
325 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.316714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3575  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.77 
 
 
325 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2093  sodium/calcium exchanger protein  26.97 
 
 
343 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0430  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.75 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.67 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3611  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.46 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.297385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3506  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.46 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1889  sodium/calcium exchanger membrane region  22.76 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3371  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  22.11 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.1 
 
 
367 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.47 
 
 
357 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.24 
 
 
319 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1369  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.08 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1317  sodium/calcium exchanger membrane region  22.07 
 
 
343 aa  56.2  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.86 
 
 
320 aa  56.2  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.92 
 
 
324 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1540  sodium/calcium exchanger membrane region  26.81 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.494574  normal  0.0390081 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4518  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.97 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.449826  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3684  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.97 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3492  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.26 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03061  predicted calcium/sodium:proton antiporter  22.64 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0199282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0511  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  21.91 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.1 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0127  sodium/calcium exchanger membrane region  21.99 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0883701  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  24.53 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03012  hypothetical protein  22.64 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0189866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.37 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3389  putative calcium/sodium:proton antiporter  21.91 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.46 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.14 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0504  putative calcium/sodium:proton antiporter  21.91 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.18976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  24.52 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.51 
 
 
319 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.25 
 
 
319 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3574  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.97 
 
 
325 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.72 
 
 
357 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2364  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.37 
 
 
353 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000100727  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  25.44 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.62 
 
 
310 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.97 
 
 
319 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.55 
 
 
310 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3809  putative calcium/sodium:proton antiporter  23.23 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  21.13 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.92 
 
 
334 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1419  sodium/calcium exchanger membrane region  23.53 
 
 
339 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258328  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.61 
 
 
358 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.91 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0521  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.48 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  20.38 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0710  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.86 
 
 
435 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.478041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  22.43 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1368  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.01 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.517687  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06241  CaCA family sodium/calcium exchanger  24.06 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.46 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>