214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3257 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 257 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  48.56 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  49.07 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  48.61 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  48.61 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  44.54 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  34.62 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  36.24 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  33.98 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  36.04 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  33.65 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  31.9 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  36.49 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  35.14 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  33.03 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  34.68 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  33.64 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  34.22 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  37.87 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  33.48 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  33.06 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  29.38 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  32.42 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  31.92 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  23.85 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  29.88 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  29 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  28.07 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  26.15 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  33.02 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  32.48 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  31.84 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  26.87 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  29 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  27.47 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  25.64 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  31.31 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  27.31 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  30.21 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  28.05 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  35.05 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  26.91 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  24.8 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  26.91 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  28.51 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.57 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  28.9 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  26.51 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  24.56 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  25.21 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  30.74 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  31.07 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  30.42 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  26.81 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  26.27 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  28.88 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  29.52 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  25.91 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  27.48 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  27.2 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  33.95 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  32.65 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  32.65 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  32.65 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  26.75 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  26.75 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  29.44 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  30.48 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  28.23 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  29.1 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  30.84 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  28.7 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  30.43 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  30.71 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  32.24 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  30.04 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  30.05 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  27.05 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  29.22 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  25.33 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  26.87 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  34.21 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  26.79 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  28.39 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  30.58 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  29.46 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  33.2 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  29.41 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  28.76 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  26.84 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  30.21 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  27.59 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  29.51 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>