More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0917 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6349  acriflavin resistance protein  40.81 
 
 		 1064 aa  702    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  45.14 
 
 		 1092 aa  852    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0835  acriflavin resistance protein  43.61 
 
 		 1042 aa  814    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181435  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0917  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1054 aa  2051    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2405  acriflavin resistance protein  37.92 
 
 		 1051 aa  611  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0140  acriflavin resistance protein  36.58 
 
 		 1026 aa  601  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0044  acriflavin resistance protein  36.24 
 
 		 1036 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1961  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.27 
 
 		 1038 aa  591  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4767  acriflavin resistance protein  35.51 
 
 		 1037 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300742  unclonable  0.0000000523741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4375  acriflavin resistance protein  35.49 
 
 		 1038 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000150121  normal  0.679218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2667  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.54 
 
 		 1035 aa  565  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1475  acriflavin resistance protein  36.96 
 
 		 1027 aa  562  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.521845  normal  0.0685081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3430  acriflavin resistance protein  35.73 
 
 		 1037 aa  558  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4429  acriflavin resistance protein  35.08 
 
 		 1059 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4289  acriflavin resistance protein  34.57 
 
 		 1055 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0104  acriflavin resistance protein  34.59 
 
 		 1056 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0111  acriflavin resistance protein  34.56 
 
 		 1059 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3672  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1061 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3726  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1061 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.226552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1050 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 		 1082 aa  425  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1011 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1086 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1034 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  29.24 
 
 		 1030 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.83 
 
 		 1043 aa  399  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 		 1034 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.2 
 
 		 1031 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.14 
 
 		 1091 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.38 
 
 		 1081 aa  396  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1085 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1031 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 		 1031 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1031 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 		 1031 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1085 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1085 aa  390  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1085 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 		 1102 aa  389  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 		 1087 aa  389  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1087 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  28.91 
 
 		 1042 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1087 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 		 1087 aa  389  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.13 
 
 		 1049 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.29 
 
 		 1044 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1046 aa  385  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1083 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.69 
 
 		 1024 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.45 
 
 		 1031 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 		 1046 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1044 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.09 
 
 		 1034 aa  379  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1031 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1031 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1031 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1031 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1023 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1038 aa  373  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1063 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1038 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1022 aa  366  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1043 aa  366  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  30.39 
 
 		 1024 aa  365  3e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1037 aa  364  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1031 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  27.64 
 
 		 1039 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 		 1036 aa  362  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1059 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1017 aa  360  5e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1048 aa  360  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1034 aa  357  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1058 aa  357  6.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.57 
 
 		 1068 aa  356  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  27.13 
 
 		 1040 aa  354  5.9999999999999994e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.49 
 
 		 1036 aa  353  1e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  29.88 
 
 		 1055 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1041 aa  353  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1053 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1034 aa  352  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1026 aa  352  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1064 aa  352  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 		 1051 aa  350  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1042 aa  348  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  26.7 
 
 		 1071 aa  345  2e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  29.91 
 
 		 1038 aa  345  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  27.65 
 
 		 1041 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1035 aa  344  5.999999999999999e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1044 aa  343  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1046 aa  343  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.61 
 
 		 1024 aa  342  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1470 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1052 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1041 aa  341  4e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1040 aa  340  9e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  26.76 
 
 		 1035 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  29.06 
 
 		 1038 aa  339  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1006 aa  339  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1024 aa  338  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1014 aa  337  5e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>