More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2351 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2351  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
158 aa  323  7e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  43.08 
 
 
147 aa  115  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  41.45 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  38.35 
 
 
156 aa  94  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 
155 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  37.01 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  42.54 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
189 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
180 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
189 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.69 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  35.92 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
162 aa  87.4  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  40.57 
 
 
189 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  35.2 
 
 
143 aa  85.5  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  40.21 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  38.74 
 
 
160 aa  84.7  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
160 aa  84.7  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
155 aa  84  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  41.05 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  44 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  46 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  45.16 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  45.16 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  39.36 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  41.05 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  41.24 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  37.01 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  34.56 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  38.3 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  39.78 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  45 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  33.93 
 
 
153 aa  79  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  36.15 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  42.22 
 
 
163 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.04 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
147 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  35.38 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  41.57 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  39.18 
 
 
148 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  39.18 
 
 
148 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3661  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  37.76 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  34.74 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1374  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2364  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  35.71 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_008501  STER_B1  molecular chaperone (small heat shock protein)  32.12 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 
186 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  31.16 
 
 
260 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>