297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2215 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 179 aa  357  4e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.75 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.75 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.75 
 
 		 183 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.11 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.69 
 
 		 183 aa  141  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  36.42 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 		 180 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  36.21 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  33.92 
 
 		 190 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  33.71 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  36.42 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  35.2 
 
 		 201 aa  104  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 		 188 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  36 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.28 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  32.16 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  32.75 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  32.76 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  35.09 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  33.52 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 		 186 aa  97.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 		 188 aa  97.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  31.61 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 		 217 aa  97.4  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  33.52 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  32.77 
 
 		 182 aa  95.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  33.53 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  31.43 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 		 183 aa  94  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  30.51 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.53 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 		 180 aa  91.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 		 180 aa  91.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  30.29 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  32.57 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 		 197 aa  89  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 		 181 aa  88.2  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 		 182 aa  87.8  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.12 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  29.38 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  29.55 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  25.84 
 
 		 182 aa  85.5  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  29.83 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  31.95 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  26.44 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  28.49 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  29.28 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  33.9 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  29.38 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  30.68 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  28.16 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  32.57 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  29.71 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  28.82 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  26.14 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  29.94 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.05 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  29.71 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0109  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00162422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>