282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2035 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  45 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  41.8 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  46.09 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  39.67 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  43.8 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  39.32 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  38.26 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  39.67 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  39.67 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  40.16 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  38.52 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  40.87 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  38.84 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0988  hypothetical protein  42.62 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.659164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.98 
 
 		 125 aa  85.5  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  36.75 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  37.29 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  37.7 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3463  hypothetical protein  43.56 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  41.03 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  34.15 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  43.56 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  39.84 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  38.33 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  37.72 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  40.16 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  37.72 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  39.42 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  38.02 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  39.67 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  35.25 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  37.39 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  37.4 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.39 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  38.14 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  36.97 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  34.43 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  38.84 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  40.34 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.67 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.48 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  36.89 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  36.94 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  36.07 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  38.26 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  38.26 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  36.07 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  33.9 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  38.26 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  35.09 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  37.86 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  41.38 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  36.84 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  34.45 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  38.18 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  38.26 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  35.09 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  39.5 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  31.15 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.92 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  37.61 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  37.04 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  37.07 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.46 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  36.07 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  35.78 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  41.49 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  36.72 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  36.89 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  35.96 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  37.3 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  39 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  36.59 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  36.07 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  35.79 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  42.11 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  36.13 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  36.21 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3004  hypothetical protein  45.26 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.350262  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3046  hypothetical protein  45.26 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339629  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  32.74 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  37.07 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  37.11 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  41.35 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  40.24 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  37.27 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  38.98 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  35.78 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  35.25 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  33.62 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  38.78 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  33.33 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  36.44 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  32.76 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  35.45 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>