More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2276 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
776 aa  1585    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.12 
 
 
777 aa  983    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.99 
 
 
794 aa  980    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.21 
 
 
777 aa  1068    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.23 
 
 
793 aa  962    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.89 
 
 
777 aa  994    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  42.67 
 
 
771 aa  629  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  41.99 
 
 
771 aa  611  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  58.13 
 
 
635 aa  551  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.19 
 
 
578 aa  211  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.43 
 
 
577 aa  205  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  39.4 
 
 
381 aa  206  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.19 
 
 
552 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.43 
 
 
578 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.07 
 
 
578 aa  201  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.42 
 
 
578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.83 
 
 
546 aa  194  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.42 
 
 
542 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.26 
 
 
579 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.68 
 
 
559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.68 
 
 
559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.17 
 
 
541 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.5 
 
 
558 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.59 
 
 
544 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.18 
 
 
579 aa  174  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.86 
 
 
571 aa  173  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2193  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.42 
 
 
648 aa  173  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.119268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.53 
 
 
1105 aa  172  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.54 
 
 
543 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.03 
 
 
1487 aa  169  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0703  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.83 
 
 
543 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 
891 aa  157  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.63 
 
 
1481 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2158  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.57 
 
 
585 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.625717  normal  0.662886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.08 
 
 
895 aa  154  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.47 
 
 
445 aa  153  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.6 
 
 
914 aa  152  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.87 
 
 
1410 aa  151  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.12 
 
 
1126 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  29.85 
 
 
465 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  30.64 
 
 
468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  30.4 
 
 
468 aa  148  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.52 
 
 
653 aa  146  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.44 
 
 
608 aa  146  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  26.43 
 
 
658 aa  146  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1067  putative glutamate synthase (NADPH)  26.26 
 
 
597 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1292  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.86 
 
 
398 aa  142  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  28.64 
 
 
413 aa  142  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.26 
 
 
996 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.07 
 
 
1426 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1661  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.71 
 
 
648 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  27.31 
 
 
688 aa  141  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.45 
 
 
609 aa  140  8.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  28.39 
 
 
413 aa  140  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.26 
 
 
480 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1671  selenate reductase YgfK  27.52 
 
 
1009 aa  139  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.11 
 
 
699 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  29.28 
 
 
1150 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  27.68 
 
 
464 aa  138  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.11 
 
 
1073 aa  138  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  30.52 
 
 
653 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  30.95 
 
 
495 aa  137  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1136  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.83 
 
 
598 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  28.22 
 
 
455 aa  137  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.6 
 
 
596 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2477  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.65 
 
 
653 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.47 
 
 
1421 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  31.35 
 
 
463 aa  135  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.74 
 
 
1424 aa  135  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  28.31 
 
 
493 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  30.94 
 
 
485 aa  135  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  31.08 
 
 
486 aa  134  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  25.13 
 
 
1385 aa  134  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.47 
 
 
1425 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  28.36 
 
 
1387 aa  134  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.79 
 
 
457 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.57 
 
 
1425 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.04 
 
 
647 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.33 
 
 
1425 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3278  putative oxidoreductase  31.25 
 
 
412 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.598108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  28.84 
 
 
479 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02075  predicted oxidoreductase  31.25 
 
 
412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1512  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.25 
 
 
412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1502  putative oxidoreductase  31.25 
 
 
412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  28.86 
 
 
997 aa  132  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02034  hypothetical protein  31.25 
 
 
412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.85 
 
 
612 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.94 
 
 
612 aa  131  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  27.61 
 
 
1412 aa  132  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  29.26 
 
 
469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.78 
 
 
612 aa  131  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.53 
 
 
1440 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  27.9 
 
 
653 aa  131  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  28.12 
 
 
465 aa  130  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.49 
 
 
1440 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.27 
 
 
476 aa  130  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2280  putative oxidoreductase  30.29 
 
 
412 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  30.33 
 
 
503 aa  130  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  29.5 
 
 
471 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>