More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2272 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  54.65 
 
 		 711 aa  749    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  64.53 
 
 		 733 aa  978    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  58.71 
 
 		 734 aa  845    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  54.42 
 
 		 695 aa  786    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  63.12 
 
 		 727 aa  974    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  50.78 
 
 		 713 aa  721    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  45.5 
 
 		 728 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  49.72 
 
 		 722 aa  688    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  46.53 
 
 		 729 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  49.28 
 
 		 697 aa  671    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  56.08 
 
 		 699 aa  806    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  50.64 
 
 		 714 aa  711    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  50.42 
 
 		 727 aa  707    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  49.15 
 
 		 714 aa  680    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  64.51 
 
 		 726 aa  985    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  58.1 
 
 		 723 aa  880    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  55.71 
 
 		 721 aa  788    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  63.64 
 
 		 723 aa  955    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  45.31 
 
 		 732 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  54.71 
 
 		 697 aa  792    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  47.78 
 
 		 706 aa  643    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  47.01 
 
 		 702 aa  672    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 723 aa  1501    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  53.58 
 
 		 730 aa  746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  46.95 
 
 		 727 aa  654    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  48.07 
 
 		 696 aa  648    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  54.09 
 
 		 718 aa  761    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  47.23 
 
 		 723 aa  644    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  49.43 
 
 		 697 aa  659    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  57.24 
 
 		 730 aa  879    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  53.3 
 
 		 729 aa  773    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  54.06 
 
 		 724 aa  798    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  53.43 
 
 		 695 aa  780    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  48.79 
 
 		 724 aa  663    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  62.68 
 
 		 723 aa  915    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  55.62 
 
 		 716 aa  787    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  53 
 
 		 702 aa  750    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  64.88 
 
 		 726 aa  995    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  51.58 
 
 		 697 aa  735    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  51.15 
 
 		 695 aa  712    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  64.01 
 
 		 725 aa  947    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  58.59 
 
 		 722 aa  879    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  54.98 
 
 		 717 aa  801    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  55.17 
 
 		 701 aa  768    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  53.79 
 
 		 695 aa  784    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  50 
 
 		 714 aa  693    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  61.9 
 
 		 721 aa  929    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  53.29 
 
 		 695 aa  780    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  47.23 
 
 		 728 aa  668    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  52.96 
 
 		 724 aa  798    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  63.22 
 
 		 725 aa  952    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  63.64 
 
 		 726 aa  988    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  51.8 
 
 		 703 aa  728    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  49.72 
 
 		 712 aa  697    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  46.18 
 
 		 729 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  53.01 
 
 		 697 aa  744    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  56 
 
 		 705 aa  791    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  42.92 
 
 		 699 aa  568  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  42.39 
 
 		 676 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  38.69 
 
 		 688 aa  484  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  37.68 
 
 		 688 aa  451  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  37.03 
 
 		 716 aa  414  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  29.26 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  30.96 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  30.69 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  29.72 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  33.82 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  28.36 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  31.68 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  28.04 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  27.72 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  24.91 
 
 		 470 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  24.57 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  32.28 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  29.26 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  29.12 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  39.56 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  29.26 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  29.12 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  28.29 
 
 		 470 aa  73.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  31.5 
 
 		 444 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  26.35 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  26.35 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  26.01 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  27.87 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  25.98 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  29.5 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  29.51 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  28.5 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  27.94 
 
 		 440 aa  70.5  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  30.1 
 
 		 448 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3244  glutamine synthetase, type I  28.37 
 
 		 468 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  31.11 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>