More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1249 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  550  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  47.06 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  47.66 
 
 
265 aa  211  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
275 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
263 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  42.01 
 
 
273 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
298 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
280 aa  196  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.28 
 
 
280 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
275 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 
274 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 
274 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 
274 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.86 
 
 
184 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
278 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.561593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
279 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.931829  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
274 aa  153  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  42.93 
 
 
253 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 
267 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  42.05 
 
 
253 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  41.88 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
602 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 
588 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 
588 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 
588 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 
273 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 
258 aa  136  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  33.96 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  33.83 
 
 
295 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
256 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 
255 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  30.42 
 
 
276 aa  133  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
255 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
317 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
595 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
252 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  41.54 
 
 
253 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288713 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 
595 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 
595 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 
595 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  37.57 
 
 
276 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
286 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 
602 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
568 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 
249 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
244 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 
595 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
250 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
276 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  37.84 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
250 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
309 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
602 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 
618 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.1 
 
 
260 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
251 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  32.44 
 
 
590 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
276 aa  125  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
276 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
248 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 
253 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
596 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
251 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
292 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
251 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
286 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.930868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
244 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
596 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
596 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 
286 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 
595 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.06 
 
 
260 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
295 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>