More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0600 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.78 
 
 
183 aa  165  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.22 
 
 
180 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.33 
 
 
180 aa  137  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.33 
 
 
180 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.78 
 
 
180 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.56 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  35.59 
 
 
179 aa  123  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.44 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.24 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.7 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.79 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.6 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
179 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
179 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 
179 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.28 
 
 
179 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
186 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
186 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
179 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  30 
 
 
182 aa  101  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
186 aa  101  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
186 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
186 aa  98.6  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
193 aa  97.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 
180 aa  97.4  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 
180 aa  97.4  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  32.94 
 
 
190 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  31.76 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.15 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
186 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  31.03 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
179 aa  92  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.75 
 
 
192 aa  91.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  29.78 
 
 
179 aa  91.3  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
186 aa  91.3  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  29.07 
 
 
189 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  28.49 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  28.89 
 
 
194 aa  89  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  28.49 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
188 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  30.64 
 
 
188 aa  88.6  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  31.76 
 
 
190 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
180 aa  87.4  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  31.03 
 
 
173 aa  87.4  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  26.32 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  30.9 
 
 
180 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  28.33 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  27.75 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  30.23 
 
 
190 aa  85.1  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  32.18 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.32 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  27.59 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  26.32 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  27.59 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  28.07 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4750  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  29.89 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4133  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  normal  0.0205692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3928  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0640299  hitchhiker  0.00610121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4020  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183968  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  26.86 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  31.21 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3755  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  31.03 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  26.63 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  26.59 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.88 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.29 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>