More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2650 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  32.59 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 182 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  30.86 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  28.1 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  25.62 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  26.79 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  30.65 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  30.36 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  22.58 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.52 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.52 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  25.35 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  31.65 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  32.93 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 292 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 200 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  29.67 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 219 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  27.06 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  28.09 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  26.53 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>