More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5613 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5613  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 388 aa  793    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2348  protein of unknown function DUF214  61.08 
 
 		 384 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.555804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  24.18 
 
 		 869 aa  89.4  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2862  hypothetical protein  26.62 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.27 
 
 		 816 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  24.75 
 
 		 821 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  23.95 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  24 
 
 		 796 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3720  hypothetical protein  24.18 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 804 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  28.98 
 
 		 807 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  23.58 
 
 		 831 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.66 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2408  hypothetical protein  24.65 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  23.21 
 
 		 797 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  21.2 
 
 		 809 aa  70.1  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  23.35 
 
 		 803 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  22.66 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.15 
 
 		 807 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 788 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  23.87 
 
 		 804 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.3 
 
 		 642 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.57 
 
 		 641 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 805 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  26.33 
 
 		 802 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  27.05 
 
 		 887 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  24.31 
 
 		 814 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 		 800 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.32 
 
 		 823 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  22.34 
 
 		 795 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  23.87 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  23.44 
 
 		 802 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  25 
 
 		 805 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  24.1 
 
 		 810 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.64 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.55 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3258  hypothetical protein  22.54 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.75 
 
 		 862 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 		 818 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  25.36 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  25.36 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  24.41 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  25.26 
 
 		 819 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  34.51 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  21.96 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  25.71 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  23.62 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4070  hypothetical protein  23.42 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  23.56 
 
 		 810 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  24.23 
 
 		 806 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 		 785 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  23.47 
 
 		 793 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  34.51 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  22.67 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.67 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.67 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  22.67 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.67 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  22.67 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.98 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  21.61 
 
 		 801 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  21.8 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  26.06 
 
 		 682 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  25.77 
 
 		 667 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  22.28 
 
 		 808 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  24.42 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  21.65 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  20.38 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  26.06 
 
 		 682 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.86 
 
 		 874 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  23.84 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  24.04 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.59 
 
 		 915 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  26.47 
 
 		 811 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 810 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  26.15 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.36 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  24.27 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3690  ABC transporter, permease protein  22.49 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.3 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  23.12 
 
 		 817 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  25.46 
 
 		 667 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.57 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.77 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  22.57 
 
 		 809 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.12 
 
 		 883 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  21.4 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2989  hypothetical protein  23.75 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  21.11 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  22.87 
 
 		 696 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.43 
 
 		 913 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  26.94 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.14 
 
 		 809 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1000  hypothetical protein  23.75 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  22.36 
 
 		 809 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1033  hypothetical protein  23.75 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>