249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5483 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 320 aa  648    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  43.44 
 
 		 320 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  33.01 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  29.09 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  30.03 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  28.62 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  30.07 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  29.27 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  29.3 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 		 343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  29.59 
 
 		 611 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  26.45 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  27.08 
 
 		 339 aa  109  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  30.24 
 
 		 595 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  28.06 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  28.46 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  28.42 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  28.42 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.59 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  31.01 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.65 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.39 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  25.89 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  24.91 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  25.97 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 533 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.86 
 
 		 517 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  28.89 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  28.86 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  27.86 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  28.41 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  27.14 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  30.4 
 
 		 690 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  27.52 
 
 		 619 aa  93.2  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  26.51 
 
 		 330 aa  92.4  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  26.43 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  26.43 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  22.97 
 
 		 607 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  25.89 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  25.89 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  25.89 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  28.46 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.29 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.84 
 
 		 338 aa  89.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  27.73 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  27.9 
 
 		 667 aa  89.7  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  25.23 
 
 		 530 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  26.64 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  32.02 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  27.36 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  22.37 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  25.31 
 
 		 601 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  27.56 
 
 		 599 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  26.64 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  26.52 
 
 		 359 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  25.71 
 
 		 336 aa  86.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  23.48 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  27.69 
 
 		 646 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.48 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 612 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  27.48 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  25.97 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  26.58 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  26.48 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 701 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  26.27 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  25 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  27.83 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  25.48 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  26.44 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  29.49 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  26.39 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  25.09 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  25.75 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  26.25 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.52 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  23.85 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  23.92 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  28.36 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  28.62 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  25.47 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  24.28 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>