More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4369 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  75.12 
 
 		 201 aa  329  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  68.32 
 
 		 202 aa  298  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  66.67 
 
 		 201 aa  298  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  64.68 
 
 		 201 aa  285  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 200 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  64.85 
 
 		 201 aa  274  6e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  63.86 
 
 		 201 aa  272  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  64.85 
 
 		 201 aa  271  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  64.18 
 
 		 200 aa  270  1e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  59.41 
 
 		 201 aa  254  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1391  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.44 
 
 		 201 aa  228  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  52.74 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0456  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.189833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0517  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 208 aa  211  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  51.74 
 
 		 200 aa  208  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 203 aa  206  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  50.25 
 
 		 203 aa  205  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  50.25 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 203 aa  201  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  49.51 
 
 		 203 aa  201  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2145  ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 206 aa  201  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.592371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 203 aa  201  9e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  52.66 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  49.01 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  49.76 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 203 aa  198  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04497  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777393  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  50.25 
 
 		 262 aa  198  3.9999999999999996e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 200 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  46.83 
 
 		 205 aa  197  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  51.94 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2994  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 207 aa  194  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2925  30S ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3155  30S ribosomal protein S4  48.31 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0507  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0166592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4725  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766159  normal  0.270309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0478  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3292  30S ribosomal protein S4  48.31 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0511  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595592  normal  0.0197267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3272  30S ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 206 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  48.76 
 
 		 200 aa  191  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5056  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00247728  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0077  ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0779  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 203 aa  188  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  48.31 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06490  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0983  SSU ribosomal protein S4P  48.56 
 
 		 206 aa  187  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923822  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 205 aa  187  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3885  30S ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3418  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.122235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2302  30S ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  50.49 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  49.29 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0650  ribosomal protein S4  48.31 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4525  30S ribosomal protein S4  48.31 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815516  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  46.38 
 
 		 207 aa  186  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  48.31 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  50.74 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  48.8 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 206 aa  185  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 207 aa  185  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  47.34 
 
 		 206 aa  185  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  45.93 
 
 		 208 aa  185  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>