210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3103 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 256 aa  527  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  36.86 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  29.63 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  27.51 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  28.78 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  30.12 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.92 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  27.99 
 
 		 280 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.51 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  30.36 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  30.04 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.06 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  25.56 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  27.61 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  27.24 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  25.1 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  26.34 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  27.55 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  25.29 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  26.09 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.19 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  26.11 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  28.97 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  29.37 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  30.04 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  25.67 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  27.36 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  25.91 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  23.53 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.56 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  28.84 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  25.94 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  25.94 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  28.86 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  25.59 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  27.93 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  26.34 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  24.61 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  25.74 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  25.11 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  28.43 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  24.32 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  27.53 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  33.12 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  26.47 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  27.68 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  26.55 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  28.66 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  25.84 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  25.84 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  31.87 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  26.97 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  24.9 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  32.42 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  28.57 
 
 		 281 aa  62  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  25.48 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  24.23 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  32.65 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  43.62 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  24.23 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  26.87 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  27.78 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  23.79 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  35.11 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  25.51 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  27.03 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  25.14 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  34.02 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  24.68 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  25.51 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  25.51 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  34.38 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  34.38 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  24.35 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  26.48 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  34.38 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  25.57 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  28.09 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  27.31 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  29.52 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  35.19 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  27.43 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  26.05 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  24.73 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  25.51 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  32.67 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  24.9 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  28.3 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  28.3 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  26.29 
 
 		 345 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  26.29 
 
 		 345 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  33.68 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>