187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2169 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 305 aa  613  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  36.7 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  28.75 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  29.32 
 
 		 303 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  30.3 
 
 		 312 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  30.3 
 
 		 312 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  26.97 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  33.73 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  26.47 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  26.91 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  26.97 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  26.97 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  26.91 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  27.53 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  25.68 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  27.54 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  29.01 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  27.69 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  22.8 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.94 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  28.7 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  27.42 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  26.36 
 
 		 227 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  21.78 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  22.82 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  23.34 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  26.35 
 
 		 460 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  28.7 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  25.85 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  25.11 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  22.61 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  22.34 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  24.44 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  26.11 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  26.11 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  24.21 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  24.71 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  23.66 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  25.78 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  21.88 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  24.57 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  25.78 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  25.78 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  25.78 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  25.78 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  25.78 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  25.78 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  25.78 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  21.03 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  23.16 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  25.39 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  23.81 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  24.27 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  22.73 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  25.87 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  22.22 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  25.39 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  25.39 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  22.22 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  25.39 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  25.39 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08791  CDF iron transporter (Eurofung)  21.43 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221743  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  21.6 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  21.48 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  24.43 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  24.56 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  22.94 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  25.86 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1673  cation diffusion facilitator family transporter  23.19 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.569502 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  24.07 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  25.24 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  27.8 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.07 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  24.26 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  23.69 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  24.7 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  22.87 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  22.9 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  22.26 
 
 		 483 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  25 
 
 		 462 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  21.96 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  22.38 
 
 		 310 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  25.1 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  21.65 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  26.15 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  26.99 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  24.27 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  23.39 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  21.96 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  23.37 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>