115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1403 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 293 aa  613  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  70.83 
 
 		 300 aa  465  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.52 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.63 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.04 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.77 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.74 
 
 		 268 aa  85.5  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.16 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  24.32 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.66 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.84 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.63 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.07 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.99 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  28.76 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.08 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.73 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.44 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.53 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.77 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.84 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.84 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.78 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.49 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.05 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.49 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.84 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  26.01 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.8 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.92 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.54 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.24 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.57 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.55 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.72 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.15 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.87 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  21.9 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.55 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  22.22 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  25.23 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.18 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.55 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.62 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.11 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  24.9 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.12 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.15 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.11 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.58 
 
 		 268 aa  53.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.11 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.26 
 
 		 230 aa  52.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  26.07 
 
 		 266 aa  52.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.27 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  27.19 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  31.78 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  26.7 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.03 
 
 		 253 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43737  phytanoyl-coa dioxygenase  24.54 
 
 		 409 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  32.54 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.83 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  27.16 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  26.77 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.85 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.09 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.37 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  26.55 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  25.33 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.11 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  26.32 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.87 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.55 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.63 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  26.92 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.17 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  26.25 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  25.98 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  24.62 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  26.32 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.45 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  25 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.68 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  25.29 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  24.62 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  24.62 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.62 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  24.62 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.43 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>