283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1792 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  327  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  50.7 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  45.86 
 
 		 134 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  44.78 
 
 		 134 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  53.97 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  45.79 
 
 		 202 aa  99  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  47.06 
 
 		 127 aa  96.3  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  45.54 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  41.03 
 
 		 129 aa  91.7  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  41.88 
 
 		 126 aa  90.9  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  42.74 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  41.59 
 
 		 125 aa  89  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  49.11 
 
 		 139 aa  87.4  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  40.83 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  46.09 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  40.71 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  42.62 
 
 		 123 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  45.45 
 
 		 123 aa  85.5  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  43.52 
 
 		 121 aa  85.5  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  44.35 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  42.48 
 
 		 127 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  36.97 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  42.15 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  40.48 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  39.68 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  47.37 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.98 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  42.98 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  42.15 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  42.98 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  48.48 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  34.48 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  41.53 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  49.49 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  36.94 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  39.2 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  41.67 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  41.67 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  46.43 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  39.5 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  46.36 
 
 		 118 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  37.9 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  45.26 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  31.86 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  32.14 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  37.88 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  41.59 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  40 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  45.05 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  43.14 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  41.96 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  41.88 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  33.62 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  34.82 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  37.84 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  40.88 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  41.23 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  40.21 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  43.16 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  38.26 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  38.94 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  40.98 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  39.81 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  37.61 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  42.73 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  39.64 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  42.99 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  33.62 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.26 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  51.22 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  37.93 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  39 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  34.74 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  36.63 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  41.67 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  38.26 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  42 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  42.48 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  42.48 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  42.48 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  42.48 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  40.71 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  40.62 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  42.5 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  41.59 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  42.48 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  33.68 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  41.05 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  34.82 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  41.05 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  39.29 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  44.44 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  34.19 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  42.74 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  42.2 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  44.95 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  35.42 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>