198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2036 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  35.84 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  32.26 
 
 		 313 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  26.04 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  26.88 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  42.5 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  24.3 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  37.5 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  32.04 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  43.02 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  32.04 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  31.69 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  24.48 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  24.48 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  32.58 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  26.93 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  24.28 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  25.29 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  24.85 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  27.79 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  42.42 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  42.42 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  30.19 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  31.5 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  42.42 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  24.39 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  25.15 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  36.76 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  23.41 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  36.49 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  23.28 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  32.41 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  26.93 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  23.96 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  28.28 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  41.54 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  36.71 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.25 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  26.29 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  31.4 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  35.44 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  30.63 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  37.93 
 
 		 245 aa  57  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  39.39 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  34.21 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  38.33 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  23.18 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  39.39 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  40 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  39.39 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  39.39 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  39.39 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  39.39 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  34.07 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  39.39 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  24.35 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  38.03 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.27 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  39.39 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 199 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  36.99 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  33.78 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  34.94 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  40.98 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  31.25 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  41.27 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  33.9 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  29.91 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  28.8 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  35.82 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  35.82 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  38.81 
 
 		 284 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 329 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  35.94 
 
 		 266 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  35.38 
 
 		 246 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  39.44 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  21.98 
 
 		 323 aa  52.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  39.44 
 
 		 290 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  39.44 
 
 		 292 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  36.07 
 
 		 361 aa  52.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>