More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1344 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  100 
 
 
121 aa  245  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  69.61 
 
 
143 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  62.26 
 
 
117 aa  147  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  50.41 
 
 
122 aa  123  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  46.9 
 
 
120 aa  121  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  41.74 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  36.97 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  36.7 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2649  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2302  heat shock protein Hsp20  40.45 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  34.17 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  37.74 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  37.74 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  38.39 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  33.33 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  32.48 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  32.38 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  30.58 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  30.77 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.66 
 
 
260 aa  67.4  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  33.65 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  33.33 
 
 
133 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  35.29 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
163 aa  67  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  33.66 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  33.66 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  33.66 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  33.66 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  33.66 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  33.66 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  33.66 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1568  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
251 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  30.63 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  28.7 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  31.73 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  28.85 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  29.25 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  31.25 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  29.13 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  25.96 
 
 
162 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  30.39 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  25.96 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  30.61 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  29.36 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  33.67 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>