82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3593 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0350  porin LamB type  73.84 
 
 		 511 aa  781    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  57.51 
 
 		 505 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0394  porin LamB type  70.93 
 
 		 519 aa  761    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  85.34 
 
 		 538 aa  923    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  100 
 
 		 539 aa  1113    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  56.03 
 
 		 505 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0890  sucrose porin precursor  51.11 
 
 		 540 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0763  porin, LamB type  50.55 
 
 		 525 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00125923  normal  0.916374 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0257  porin, LamB type  50.82 
 
 		 504 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51790  sucrose porin  42.59 
 
 		 539 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51510  sucrose porin  46.11 
 
 		 535 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000601  maltoporin  44.73 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00907071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3435  porin LamB type  40.89 
 
 		 550 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0966151  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  25.96 
 
 		 531 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  26.64 
 
 		 423 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  27.09 
 
 		 423 aa  87  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  26.09 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  26.09 
 
 		 452 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  26.09 
 
 		 452 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  25.87 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  27.69 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  27.69 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  27.69 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  25.87 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  26.33 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  26.62 
 
 		 463 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  25.27 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  24.77 
 
 		 434 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  25.17 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  24.94 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  25.44 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  24.78 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  24.78 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  24.78 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  24.78 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  25.44 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  24.78 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  24.78 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  24.57 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  24.53 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  25.59 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  25.11 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  26.4 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  23.83 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4204  hypothetical protein  56.52 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  32.67 
 
 		 435 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  24.04 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  25.17 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  22.45 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  22.45 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  24.94 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  22.45 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  24.83 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  25.05 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0766  glycoporin  36.29 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  29.94 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  30.05 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  23.86 
 
 		 407 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2437  porin LamB type  25.49 
 
 		 545 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  28.39 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1706  porin LamB type  24.62 
 
 		 532 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.973394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1736  glucoside specific outer membrane porin BglH-like protein  23.03 
 
 		 557 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05328  porin transmembrane protein  31.82 
 
 		 414 aa  47  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1636  glucoside specific outer membrane porin BglH  23.03 
 
 		 557 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5352  glycoporin RafY  31.25 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6198  porin LamB type  22.49 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0268727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3690  maltoporin precursor  23.9 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2999  putative glycoporin  32.5 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.419579  hitchhiker  0.000157267 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03735  hypothetical protein  31.25 
 
 		 464 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03548  hypothetical protein  22.83 
 
 		 538 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03604  carbohydrate-specific outer membrane porin, cryptic  22.83 
 
 		 538 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4229  glucoside specific outer membrane porin BglH  22.83 
 
 		 538 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03786  putative glycoporin  31.25 
 
 		 464 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1101  hypothetical protein  28.99 
 
 		 157 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4291  glycoporin RafY  29.79 
 
 		 464 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216775 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4274  porin LamB type  23.76 
 
 		 538 aa  45.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3934  glucoside specific outer membrane porin BglH  23.76 
 
 		 538 aa  45.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.551157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3090  hypothetical protein  31.88 
 
 		 538 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4247  porin LamB type  23.76 
 
 		 538 aa  45.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2933  putative glycoporin  32.5 
 
 		 456 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0271208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  23.27 
 
 		 411 aa  44.3  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  27.1 
 
 		 173 aa  43.5  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>