17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03786 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03786  putative glycoporin  100 
 
 		 464 aa  963    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03735  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  963    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5352  glycoporin RafY  99.14 
 
 		 464 aa  957    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3383  glycoporin RafY  78.67 
 
 		 464 aa  738    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3117  glycoporin RafY  78.67 
 
 		 464 aa  738    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.303437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4291  glycoporin RafY  98.92 
 
 		 464 aa  957    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2933  putative glycoporin  60.89 
 
 		 456 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0271208  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2999  putative glycoporin  60.89 
 
 		 456 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.419579  hitchhiker  0.000157267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3016  putative glycoporin  60.47 
 
 		 456 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2964  putative glycoporin  60.47 
 
 		 456 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  hitchhiker  0.00105838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4204  hypothetical protein  53.49 
 
 		 469 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0766  glycoporin  46.67 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618406  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04805  hypothetical protein  40.05 
 
 		 374 aa  257  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3712  putative glycoporin  27.61 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.87556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0213  hypothetical protein  25.51 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  45.31 
 
 		 505 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  37.88 
 
 		 539 aa  43.5  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>