16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3712 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3712  putative glycoporin  100 
 
 		 327 aa  652    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.87556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3016  putative glycoporin  31.21 
 
 		 456 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2964  putative glycoporin  30.72 
 
 		 456 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  hitchhiker  0.00105838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2999  putative glycoporin  30.43 
 
 		 456 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.419579  hitchhiker  0.000157267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2933  putative glycoporin  29.86 
 
 		 456 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0271208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03786  putative glycoporin  27.61 
 
 		 464 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03735  hypothetical protein  27.61 
 
 		 464 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4291  glycoporin RafY  27.61 
 
 		 464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5352  glycoporin RafY  27.35 
 
 		 464 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04805  hypothetical protein  27.27 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3383  glycoporin RafY  26.61 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3117  glycoporin RafY  26.61 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.303437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4204  hypothetical protein  27.3 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0766  glycoporin  24.94 
 
 		 494 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0213  hypothetical protein  28.33 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3318  hypothetical protein  27.17 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>