24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4204 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4204  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  967    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2933  putative glycoporin  57.98 
 
 		 456 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0271208  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2964  putative glycoporin  57.77 
 
 		 456 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  hitchhiker  0.00105838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2999  putative glycoporin  58.21 
 
 		 456 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.419579  hitchhiker  0.000157267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3016  putative glycoporin  57.35 
 
 		 456 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112246 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03786  putative glycoporin  54.66 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03735  hypothetical protein  54.66 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5352  glycoporin RafY  54.66 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4291  glycoporin RafY  54.45 
 
 		 464 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3383  glycoporin RafY  55.12 
 
 		 464 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3117  glycoporin RafY  55.12 
 
 		 464 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.303437 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0766  glycoporin  51.93 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618406  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04805  hypothetical protein  35.41 
 
 		 374 aa  223  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3712  putative glycoporin  27.3 
 
 		 327 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.87556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  60.56 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  57.69 
 
 		 539 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0213  hypothetical protein  25.21 
 
 		 335 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  40.4 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0350  porin LamB type  55.67 
 
 		 511 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  42.75 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0394  porin LamB type  55.67 
 
 		 519 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3435  porin LamB type  35.56 
 
 		 550 aa  47  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0966151  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2758  glycosyl transferase, group 1  43.42 
 
 		 627 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0225  hypothetical protein  25.09 
 
 		 316 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.31889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>