75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2906 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  100 
 
 		 505 aa  1036    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  57.51 
 
 		 539 aa  635    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  59.44 
 
 		 538 aa  645    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0350  porin LamB type  64.51 
 
 		 511 aa  661    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  80.99 
 
 		 505 aa  832    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0394  porin LamB type  63.9 
 
 		 519 aa  656    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0257  porin, LamB type  50.59 
 
 		 504 aa  490  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0890  sucrose porin precursor  52.27 
 
 		 540 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0763  porin, LamB type  53.35 
 
 		 525 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00125923  normal  0.916374 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000601  maltoporin  45.38 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00907071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51510  sucrose porin  46.17 
 
 		 535 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51790  sucrose porin  45.65 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3435  porin LamB type  40.07 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0966151  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  27.93 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  27.11 
 
 		 411 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  24.77 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  25.59 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  27.9 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  25.11 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  26.39 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  25.32 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  26.29 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  25.32 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  25.81 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  26.1 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  27.87 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  27.11 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  25.65 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  25.39 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  25.39 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  25.39 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  25.8 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  25.8 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  25.8 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  25.44 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  26.32 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  24.19 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  25.17 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  25.06 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  23.39 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  24.83 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  25.81 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  25.43 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  28.32 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  24.33 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03735  hypothetical protein  37 
 
 		 464 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03786  putative glycoporin  37 
 
 		 464 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  26.63 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4291  glycoporin RafY  36 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5352  glycoporin RafY  37 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  25.16 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  24.01 
 
 		 435 aa  53.5  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  29.14 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  29.14 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  29.14 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  29.14 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  29.14 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  29.14 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4204  hypothetical protein  40.4 
 
 		 469 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  29.14 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  29.14 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0766  glycoporin  37.5 
 
 		 494 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  30.34 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3016  putative glycoporin  35.71 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2999  putative glycoporin  35.71 
 
 		 456 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.419579  hitchhiker  0.000157267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2964  putative glycoporin  35.71 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  hitchhiker  0.00105838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2933  putative glycoporin  35.71 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0271208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  26.72 
 
 		 540 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3690  maltoporin precursor  23.22 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0553  maltoporin  29.17 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1736  glucoside specific outer membrane porin BglH-like protein  24.08 
 
 		 557 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1781  maltoporin precursor  23.67 
 
 		 395 aa  45.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2740  porin LamB type  26 
 
 		 518 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1636  glucoside specific outer membrane porin BglH  25.82 
 
 		 557 aa  43.9  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2437  porin LamB type  25.27 
 
 		 545 aa  43.5  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>