17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0766 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0766  glycoporin  100 
 
 		 494 aa  1009    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4204  hypothetical protein  51.52 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4291  glycoporin RafY  46.46 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216775 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03735  hypothetical protein  46.67 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5352  glycoporin RafY  46.26 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2964  putative glycoporin  50.11 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  hitchhiker  0.00105838 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3016  putative glycoporin  49.66 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112246 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03786  putative glycoporin  46.67 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3117  glycoporin RafY  48.16 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.303437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2999  putative glycoporin  49.89 
 
 		 456 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.419579  hitchhiker  0.000157267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3383  glycoporin RafY  48.16 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2933  putative glycoporin  49.89 
 
 		 456 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0271208  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04805  hypothetical protein  37.07 
 
 		 374 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3712  putative glycoporin  24.94 
 
 		 327 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.87556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0213  hypothetical protein  26.41 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  36.78 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  42.35 
 
 		 539 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>