15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3117 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03786  putative glycoporin  77.37 
 
 		 464 aa  746    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3383  glycoporin RafY  100 
 
 		 464 aa  959    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3117  glycoporin RafY  100 
 
 		 464 aa  959    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.303437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4291  glycoporin RafY  77.59 
 
 		 464 aa  751    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5352  glycoporin RafY  77.16 
 
 		 464 aa  746    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03735  hypothetical protein  77.37 
 
 		 464 aa  746    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3016  putative glycoporin  58.05 
 
 		 456 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2964  putative glycoporin  58.05 
 
 		 456 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  hitchhiker  0.00105838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2999  putative glycoporin  58.05 
 
 		 456 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.419579  hitchhiker  0.000157267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2933  putative glycoporin  58.05 
 
 		 456 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0271208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4204  hypothetical protein  52.74 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0766  glycoporin  47.12 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618406  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04805  hypothetical protein  37.77 
 
 		 374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3712  putative glycoporin  26.32 
 
 		 327 aa  105  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.87556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0213  hypothetical protein  23.55 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>