56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3435 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3435  porin LamB type  100 
 
 		 550 aa  1121    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0966151  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  40.25 
 
 		 538 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  40.52 
 
 		 539 aa  379  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  39.89 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0350  porin LamB type  42.49 
 
 		 511 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0394  porin LamB type  42.14 
 
 		 519 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215814  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  40.57 
 
 		 505 aa  347  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0257  porin, LamB type  40.22 
 
 		 504 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000601  maltoporin  43.72 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00907071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0890  sucrose porin precursor  43.95 
 
 		 540 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0763  porin, LamB type  42.25 
 
 		 525 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00125923  normal  0.916374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51790  sucrose porin  41.57 
 
 		 539 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51510  sucrose porin  37.17 
 
 		 535 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  26.98 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  26.05 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  27.58 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  25.41 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  26.3 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  24.82 
 
 		 531 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  26.83 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  25.59 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  26.98 
 
 		 411 aa  67  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  25.35 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  26.08 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  24.78 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  25 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  23.78 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  34.81 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  25.66 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  34.81 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  34.81 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  34.62 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  34.62 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  26.13 
 
 		 424 aa  57  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  24.76 
 
 		 412 aa  57  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  23.52 
 
 		 423 aa  57  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  34.62 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  34.62 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  34.62 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  34.62 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  34.62 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  34.62 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  33.54 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  34.62 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  25.9 
 
 		 424 aa  54.7  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  25.8 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0553  maltoporin  30.32 
 
 		 450 aa  53.9  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1706  porin LamB type  22.3 
 
 		 532 aa  50.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.973394  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  23.23 
 
 		 416 aa  50.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1736  glucoside specific outer membrane porin BglH-like protein  23.32 
 
 		 557 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1636  glucoside specific outer membrane porin BglH  24.76 
 
 		 557 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  32.05 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  32.05 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  32.05 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  30.46 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  28.81 
 
 		 435 aa  43.9  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>