80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4625 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  80.26 
 
 		 446 aa  746    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  80.26 
 
 		 446 aa  746    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  80.26 
 
 		 446 aa  746    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  100 
 
 		 452 aa  930    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  99.78 
 
 		 452 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  99.78 
 
 		 452 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  99.56 
 
 		 452 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  99.78 
 
 		 452 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  80.09 
 
 		 446 aa  743    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  80.26 
 
 		 446 aa  746    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  71.62 
 
 		 423 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  71.62 
 
 		 423 aa  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  70.68 
 
 		 434 aa  665    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  80.26 
 
 		 446 aa  746    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  80.26 
 
 		 446 aa  746    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  71.62 
 
 		 423 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  80.26 
 
 		 446 aa  746    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  78.68 
 
 		 444 aa  738    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  45.34 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  45.89 
 
 		 456 aa  361  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  37.78 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  37.12 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  31.93 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  32.19 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  30.72 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  30.19 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  31.94 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  33.05 
 
 		 419 aa  183  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  32.62 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  32.84 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  32.84 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  31.4 
 
 		 410 aa  180  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  29.42 
 
 		 441 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  31.39 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  31.75 
 
 		 380 aa  174  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  29.57 
 
 		 412 aa  173  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  32.12 
 
 		 416 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  29.36 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  31.08 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  30.61 
 
 		 531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  29.12 
 
 		 411 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  28.8 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  29.05 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  30.02 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6198  porin LamB type  27.55 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0268727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  26.72 
 
 		 540 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06946  hypothetical protein  24.43 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0350  porin LamB type  27.51 
 
 		 511 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0394  porin LamB type  27.02 
 
 		 519 aa  94  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2740  porin LamB type  25.65 
 
 		 518 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  27.67 
 
 		 538 aa  89  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  27.83 
 
 		 505 aa  86.7  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1736  glucoside specific outer membrane porin BglH-like protein  25.66 
 
 		 557 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  26.12 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1636  glucoside specific outer membrane porin BglH  25.6 
 
 		 557 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2437  porin LamB type  24.09 
 
 		 545 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1821  putative maltoporin  23.44 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  26.42 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2105  putative maltoporin  23.93 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.301881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3690  maltoporin precursor  25.78 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1706  porin LamB type  23.36 
 
 		 532 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.973394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03548  hypothetical protein  25.6 
 
 		 538 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03604  carbohydrate-specific outer membrane porin, cryptic  25.6 
 
 		 538 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3934  glucoside specific outer membrane porin BglH  25.6 
 
 		 538 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.551157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4274  porin LamB type  25.6 
 
 		 538 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4247  porin LamB type  25.6 
 
 		 538 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1669  porin LamB type  23.33 
 
 		 532 aa  73.2  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0257  porin, LamB type  25.6 
 
 		 504 aa  73.2  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4229  glucoside specific outer membrane porin BglH  25.54 
 
 		 538 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0034  putative maltoporin  22.77 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3843  normal  0.238888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0709  maltoporin precursor (outer membrane protein S)  23.03 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1781  maltoporin precursor  27.78 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51790  sucrose porin  27.88 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05328  porin transmembrane protein  27.72 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000601  maltoporin  22.25 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00907071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3435  porin LamB type  35.42 
 
 		 550 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0966151  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0763  porin, LamB type  30.41 
 
 		 525 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00125923  normal  0.916374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0890  sucrose porin precursor  27.84 
 
 		 540 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0553  maltoporin  25 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51510  sucrose porin  27.16 
 
 		 535 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>