59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0760 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  100 
 
 		 540 aa  1125    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1706  porin LamB type  47.14 
 
 		 532 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.973394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1669  porin LamB type  46.99 
 
 		 532 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03604  carbohydrate-specific outer membrane porin, cryptic  43.7 
 
 		 538 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4274  porin LamB type  43.89 
 
 		 538 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4229  glucoside specific outer membrane porin BglH  43.7 
 
 		 538 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03548  hypothetical protein  43.7 
 
 		 538 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3934  glucoside specific outer membrane porin BglH  43.89 
 
 		 538 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.551157  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4247  porin LamB type  43.89 
 
 		 538 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2740  porin LamB type  44.51 
 
 		 518 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2437  porin LamB type  46.37 
 
 		 545 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1736  glucoside specific outer membrane porin BglH-like protein  42.3 
 
 		 557 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1636  glucoside specific outer membrane porin BglH  42.12 
 
 		 557 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  31.47 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  28.71 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  29.65 
 
 		 435 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  30.16 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  28.74 
 
 		 419 aa  141  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  28.74 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  28.74 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  27.64 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  28.28 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  28.24 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  28.28 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  28.28 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  28.24 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  28.28 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  28.24 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  28.24 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  27.54 
 
 		 434 aa  120  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  27.73 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  26.33 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  26.48 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  26.72 
 
 		 452 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  26.72 
 
 		 452 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  26.72 
 
 		 452 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  26.72 
 
 		 452 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  26.72 
 
 		 452 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  26.38 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  26.38 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  26.38 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  25.37 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2105  putative maltoporin  24.77 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.301881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1821  putative maltoporin  24.3 
 
 		 459 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  23.23 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  24.94 
 
 		 407 aa  54.3  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  22.75 
 
 		 412 aa  53.9  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  23.43 
 
 		 539 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1666  porin, LamB family  48.98 
 
 		 51 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0034  putative maltoporin  23.39 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3843  normal  0.238888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  22.53 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  23.89 
 
 		 505 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  24.12 
 
 		 531 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  22.86 
 
 		 380 aa  47.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  22.69 
 
 		 538 aa  47  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05328  porin transmembrane protein  33.33 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  22.72 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  23.77 
 
 		 410 aa  43.9  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0709  maltoporin precursor (outer membrane protein S)  32 
 
 		 425 aa  43.5  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>