38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0034 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2105  putative maltoporin  75.22 
 
 
459 aa  745    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.301881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1821  putative maltoporin  73.91 
 
 
459 aa  732    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0034  putative maltoporin  100 
 
 
461 aa  959    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3843  normal  0.238888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0709  maltoporin precursor (outer membrane protein S)  44.86 
 
 
425 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06946  hypothetical protein  45.26 
 
 
432 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  27.42 
 
 
434 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  26.57 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  26.57 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  26.57 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  25.65 
 
 
447 aa  88.2  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  24.36 
 
 
456 aa  87.4  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  24.59 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  22.77 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  23.15 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  23.15 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  22.52 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  22.91 
 
 
452 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  23.26 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  23.39 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  23.98 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  23.98 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.571058 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  23.98 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  23.98 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  23.98 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  23.98 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  23.98 
 
 
446 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  23.98 
 
 
446 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1781  maltoporin precursor  33.33 
 
 
395 aa  60.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488444  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  21.78 
 
 
531 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  30 
 
 
416 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  28.12 
 
 
435 aa  57  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  29.52 
 
 
435 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  23.74 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6198  porin LamB type  24.55 
 
 
445 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0268727  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3690  maltoporin precursor  34.53 
 
 
395 aa  53.9  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  23.39 
 
 
540 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  28.34 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  22.66 
 
 
419 aa  43.5  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>