66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27200 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  100 
 
 		 412 aa  858    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  89.1 
 
 		 413 aa  774    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  90.53 
 
 		 412 aa  785    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  76.03 
 
 		 410 aa  624  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  71.57 
 
 		 424 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  71.07 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  70.88 
 
 		 380 aa  571  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  63.88 
 
 		 411 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  60.53 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  64.16 
 
 		 411 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  34.54 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  32.95 
 
 		 423 aa  206  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  31.57 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  32.9 
 
 		 463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  32.28 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  30.63 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  30.57 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  30.57 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  30.57 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  29.57 
 
 		 452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  29.57 
 
 		 452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  29.57 
 
 		 452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  29.57 
 
 		 452 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  29.57 
 
 		 452 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  29.45 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  29.67 
 
 		 446 aa  169  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  29.45 
 
 		 446 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  29.45 
 
 		 446 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  29.45 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  29.45 
 
 		 446 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  29.45 
 
 		 446 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  29.45 
 
 		 446 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  29.45 
 
 		 446 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  33.18 
 
 		 416 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6198  porin LamB type  27.31 
 
 		 445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0268727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  29.67 
 
 		 531 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3690  maltoporin precursor  30.46 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  30.52 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1781  maltoporin precursor  28.26 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05328  porin transmembrane protein  25.64 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  27.39 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3397  hypothetical protein  28.48 
 
 		 552 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  25.47 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  26.35 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  26.35 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  26.35 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3542  hypothetical protein  27.24 
 
 		 615 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  26.78 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  27.1 
 
 		 435 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  26.28 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  27.5 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51510  sucrose porin  25.39 
 
 		 535 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0394  porin LamB type  25.68 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  27.9 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0890  sucrose porin precursor  26.96 
 
 		 540 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0257  porin, LamB type  24.85 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0350  porin LamB type  25.57 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  24.94 
 
 		 539 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0763  porin, LamB type  26.15 
 
 		 525 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00125923  normal  0.916374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  25.25 
 
 		 538 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000601  maltoporin  24.19 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00907071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3435  porin LamB type  24.57 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0966151  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51790  sucrose porin  24.26 
 
 		 539 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06946  hypothetical protein  24.6 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  22.08 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0553  maltoporin  26.6 
 
 		 450 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>