68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51510 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51510  sucrose porin  100 
 
 		 535 aa  1094    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51790  sucrose porin  69.3 
 
 		 539 aa  746    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0890  sucrose porin precursor  57.88 
 
 		 540 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0763  porin, LamB type  56.9 
 
 		 525 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00125923  normal  0.916374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  43.41 
 
 		 538 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  42.73 
 
 		 539 aa  415  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  43.96 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0257  porin, LamB type  49.08 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0350  porin LamB type  47.89 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0394  porin LamB type  44.91 
 
 		 519 aa  402  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215814  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  42.5 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000601  maltoporin  44.61 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00907071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3435  porin LamB type  36.28 
 
 		 550 aa  289  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0966151  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  25.42 
 
 		 531 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  26.68 
 
 		 380 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  27.52 
 
 		 411 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  26.87 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  25.61 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  26.62 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  25.39 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  30.17 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  26.14 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  24.72 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  24.52 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  26.98 
 
 		 423 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  24.29 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  26.07 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  26.07 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  26.07 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  24.19 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  23.97 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  24.67 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  22.94 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  24.94 
 
 		 410 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  27.54 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  22.8 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  22.8 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  22.96 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  22.8 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  23.08 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  22.8 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  22.8 
 
 		 446 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  22.8 
 
 		 446 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  22.8 
 
 		 446 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1669  porin LamB type  23.64 
 
 		 532 aa  53.9  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  27.54 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1706  porin LamB type  22.81 
 
 		 532 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.973394  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0553  maltoporin  23.55 
 
 		 450 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2740  porin LamB type  22.83 
 
 		 518 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  23.13 
 
 		 444 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  22.15 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1736  glucoside specific outer membrane porin BglH-like protein  28.18 
 
 		 557 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1636  glucoside specific outer membrane porin BglH  27.73 
 
 		 557 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  24.34 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2437  porin LamB type  26.21 
 
 		 545 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03604  carbohydrate-specific outer membrane porin, cryptic  21.01 
 
 		 538 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03548  hypothetical protein  21.01 
 
 		 538 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  25 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3934  glucoside specific outer membrane porin BglH  21.01 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.551157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4274  porin LamB type  21.01 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4247  porin LamB type  21.01 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3690  maltoporin precursor  23.75 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  28.08 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  28.08 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_003296  RS05328  porin transmembrane protein  29.82 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  28.77 
 
 		 452 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  28.77 
 
 		 452 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  28.77 
 
 		 452 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>