77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5152 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  100 
 
 		 416 aa  843    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  37.72 
 
 		 531 aa  256  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  36.6 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  34.13 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  36.12 
 
 		 423 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  36.12 
 
 		 423 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  36.12 
 
 		 423 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  34.95 
 
 		 434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  35.06 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  32.97 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  32.97 
 
 		 446 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  32.97 
 
 		 446 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  32.97 
 
 		 446 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  33.19 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  33.19 
 
 		 446 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  33.19 
 
 		 446 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  33.19 
 
 		 446 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  33.7 
 
 		 463 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  31.96 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  34.67 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  33.4 
 
 		 468 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  32.05 
 
 		 452 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  32.05 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  31.84 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  31.84 
 
 		 452 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  31.84 
 
 		 452 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  34.42 
 
 		 410 aa  173  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  34.76 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  33.8 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  32.7 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  35.98 
 
 		 424 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  35.22 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  33.18 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  35.89 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6198  porin LamB type  32.51 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0268727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  33.49 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  29.22 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  29.4 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  27.27 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  27.27 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  27.05 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  26.92 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  28.37 
 
 		 416 aa  99  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  25.5 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  24.72 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3690  maltoporin precursor  28.9 
 
 		 395 aa  93.6  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1781  maltoporin precursor  27.91 
 
 		 395 aa  86.7  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0257  porin, LamB type  27.27 
 
 		 504 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  27.34 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  26.83 
 
 		 505 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05328  porin transmembrane protein  23.41 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000601  maltoporin  26.48 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00907071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0350  porin LamB type  24.33 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06946  hypothetical protein  24.56 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0394  porin LamB type  25.17 
 
 		 519 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  26.7 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  25.39 
 
 		 538 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3435  porin LamB type  26.04 
 
 		 550 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0966151  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51510  sucrose porin  23.78 
 
 		 535 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51790  sucrose porin  26.08 
 
 		 539 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  22.48 
 
 		 540 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0553  maltoporin  27.5 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1821  putative maltoporin  23.73 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2105  putative maltoporin  24.33 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.301881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0890  sucrose porin precursor  24.08 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0709  maltoporin precursor (outer membrane protein S)  22.81 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3934  glucoside specific outer membrane porin BglH  23.4 
 
 		 538 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.551157  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4247  porin LamB type  23.4 
 
 		 538 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4274  porin LamB type  23.4 
 
 		 538 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4229  glucoside specific outer membrane porin BglH  23.4 
 
 		 538 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03548  hypothetical protein  22.88 
 
 		 538 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03604  carbohydrate-specific outer membrane porin, cryptic  22.88 
 
 		 538 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0034  putative maltoporin  28.34 
 
 		 461 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3843  normal  0.238888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3397  hypothetical protein  27.68 
 
 		 552 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0763  porin, LamB type  22.89 
 
 		 525 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00125923  normal  0.916374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3542  hypothetical protein  28.49 
 
 		 615 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2437  porin LamB type  21.98 
 
 		 545 aa  43.9  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>