58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1781 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1781  maltoporin precursor  100 
 
 		 395 aa  797    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3690  maltoporin precursor  66.58 
 
 		 395 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05328  porin transmembrane protein  37.38 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  29.12 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  28.02 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  27.12 
 
 		 413 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  26.88 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  28.93 
 
 		 380 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  28.93 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  28.78 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  28.43 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  28.46 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  26.68 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  26.68 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  26.68 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  26.82 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  27.27 
 
 		 416 aa  93.2  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  24.67 
 
 		 452 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  24.67 
 
 		 452 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  24.67 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  24.67 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  24.67 
 
 		 452 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  25 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  25 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  25 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  25 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  25 
 
 		 446 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  25 
 
 		 446 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  25 
 
 		 446 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  25 
 
 		 446 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  27.43 
 
 		 441 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  27.11 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6198  porin LamB type  27.21 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0268727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  24.83 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  24.61 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  27.31 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  26.23 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  25.35 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  24.84 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  25.65 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1821  putative maltoporin  25.85 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0034  putative maltoporin  29.61 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3843  normal  0.238888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2105  putative maltoporin  35.42 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.301881  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  30.14 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  26.27 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  26.14 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  33.33 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  33.33 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  33.33 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  33.7 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51790  sucrose porin  23.55 
 
 		 539 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000601  maltoporin  24.47 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00907071  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06946  hypothetical protein  23.96 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  23.67 
 
 		 505 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2740  porin LamB type  28.23 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0553  maltoporin  30.53 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  29.46 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  29.46 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>