69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51790 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51790  sucrose porin  100 
 
 		 539 aa  1103    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51510  sucrose porin  70.04 
 
 		 535 aa  740    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0763  porin, LamB type  54.22 
 
 		 525 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00125923  normal  0.916374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0890  sucrose porin precursor  57.05 
 
 		 540 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  44.04 
 
 		 538 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  42.24 
 
 		 539 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  45.26 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0394  porin LamB type  45.15 
 
 		 519 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0350  porin LamB type  47.66 
 
 		 511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  43.52 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0257  porin, LamB type  45.19 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000601  maltoporin  43.67 
 
 		 479 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00907071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3435  porin LamB type  37.99 
 
 		 550 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0966151  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  24.95 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  25.82 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  24.72 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  26.75 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  26.83 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  25.88 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  25.88 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  25.88 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  26.27 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  25.88 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  25.88 
 
 		 446 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  25.16 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  28.1 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  28.1 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  25.66 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  27.43 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  25.66 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  25.66 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  26.16 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  27.88 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  27.21 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  25.33 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  24.59 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  24.25 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  24.25 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  24.25 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  26.07 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  26.07 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  26.07 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  26.05 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  26.72 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  25.38 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  24.21 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  27.81 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  29.17 
 
 		 435 aa  57  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  24.1 
 
 		 424 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  27.17 
 
 		 447 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  24.1 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  23.33 
 
 		 412 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2437  porin LamB type  21.99 
 
 		 545 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  22.98 
 
 		 407 aa  50.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  20.93 
 
 		 540 aa  50.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03604  carbohydrate-specific outer membrane porin, cryptic  21.42 
 
 		 538 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03548  hypothetical protein  21.42 
 
 		 538 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3690  maltoporin precursor  25.47 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1781  maltoporin precursor  23.18 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6198  porin LamB type  22.73 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0268727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3934  glucoside specific outer membrane porin BglH  21.42 
 
 		 538 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.551157  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4247  porin LamB type  21.42 
 
 		 538 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4274  porin LamB type  21.42 
 
 		 538 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  24.17 
 
 		 413 aa  47.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  24.03 
 
 		 411 aa  47.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  28.68 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4229  glucoside specific outer membrane porin BglH  21.42 
 
 		 538 aa  47  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1736  glucoside specific outer membrane porin BglH-like protein  24.11 
 
 		 557 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0766  glycoporin  30.95 
 
 		 494 aa  43.9  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>