60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6198 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6198  porin LamB type  100 
 
 		 445 aa  915    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0268727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  30.88 
 
 		 531 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  29.28 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  29.28 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  29.28 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  30.38 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  32.88 
 
 		 416 aa  156  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  26.06 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  29.25 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  27.23 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  27.23 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  27.23 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  27.23 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  27.23 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  27.23 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  27.23 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  27.23 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  27.55 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  27.55 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  27.33 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  27.33 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  27.33 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  26.99 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  27.31 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  27.95 
 
 		 411 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  26.14 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  28.48 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  27.79 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  25.96 
 
 		 412 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  27.38 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  27.14 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  26.37 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  23.68 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  26.75 
 
 		 468 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  27.5 
 
 		 407 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  26.35 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  27.49 
 
 		 416 aa  99  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  25.83 
 
 		 447 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  23.95 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  26.86 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  26.86 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  26.59 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06946  hypothetical protein  24.47 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  26.6 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  31.21 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  25.54 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1781  maltoporin precursor  38.46 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0034  putative maltoporin  24.55 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3843  normal  0.238888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0709  maltoporin precursor (outer membrane protein S)  21.97 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0257  porin, LamB type  24 
 
 		 504 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3690  maltoporin precursor  24.28 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0763  porin, LamB type  25.2 
 
 		 525 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00125923  normal  0.916374 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2740  porin LamB type  21.57 
 
 		 518 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51790  sucrose porin  22.73 
 
 		 539 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1821  putative maltoporin  22.15 
 
 		 459 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2105  putative maltoporin  23.83 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.301881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  22.49 
 
 		 539 aa  47.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0890  sucrose porin precursor  24.27 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000601  maltoporin  24.22 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00907071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  22.69 
 
 		 540 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>