54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1636 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1736  glucoside specific outer membrane porin BglH-like protein  98.2 
 
 		 557 aa  1131    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1636  glucoside specific outer membrane porin BglH  100 
 
 		 557 aa  1149    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2740  porin LamB type  55.05 
 
 		 518 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1706  porin LamB type  53.71 
 
 		 532 aa  598  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.973394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4247  porin LamB type  53.05 
 
 		 538 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4274  porin LamB type  53.05 
 
 		 538 aa  580  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4229  glucoside specific outer membrane porin BglH  52.87 
 
 		 538 aa  580  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03548  hypothetical protein  52.87 
 
 		 538 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3934  glucoside specific outer membrane porin BglH  53.05 
 
 		 538 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.551157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03604  carbohydrate-specific outer membrane porin, cryptic  52.87 
 
 		 538 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1669  porin LamB type  52.99 
 
 		 532 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2437  porin LamB type  51.78 
 
 		 545 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  41.93 
 
 		 540 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  29.74 
 
 		 423 aa  158  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  29.43 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  28.7 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  28.04 
 
 		 447 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  26.95 
 
 		 416 aa  123  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  25.67 
 
 		 419 aa  120  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  25.67 
 
 		 419 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  25.67 
 
 		 419 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  25.12 
 
 		 423 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1666  porin, LamB family  98.04 
 
 		 51 aa  108  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  26.44 
 
 		 444 aa  100  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  25.34 
 
 		 446 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  24.66 
 
 		 446 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  24.66 
 
 		 446 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  24.66 
 
 		 446 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  24.66 
 
 		 446 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  24.66 
 
 		 446 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  24.66 
 
 		 446 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  24.66 
 
 		 446 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  25.88 
 
 		 452 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  25.88 
 
 		 452 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  25.88 
 
 		 452 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  26.04 
 
 		 452 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  26.04 
 
 		 452 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  27.44 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  24.38 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  23.83 
 
 		 456 aa  72  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  24.38 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  24.38 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  24.38 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  23.93 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  23.79 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  22.38 
 
 		 531 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0709  maltoporin precursor (outer membrane protein S)  23.55 
 
 		 425 aa  51.6  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0257  porin, LamB type  26.46 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51510  sucrose porin  27.73 
 
 		 535 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  22.39 
 
 		 505 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0890  sucrose porin precursor  26.71 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3435  porin LamB type  24.76 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0966151  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_003296  RS05328  porin transmembrane protein  26.01 
 
 		 414 aa  44.3  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06946  hypothetical protein  22.72 
 
 		 432 aa  43.5  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>