53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1669 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1706  porin LamB type  81.82 
 
 		 532 aa  920    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.973394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1669  porin LamB type  100 
 
 		 532 aa  1095    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4247  porin LamB type  57.41 
 
 		 538 aa  618  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4274  porin LamB type  57.41 
 
 		 538 aa  618  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3934  glucoside specific outer membrane porin BglH  57.41 
 
 		 538 aa  618  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.551157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03604  carbohydrate-specific outer membrane porin, cryptic  57.22 
 
 		 538 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03548  hypothetical protein  57.22 
 
 		 538 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4229  glucoside specific outer membrane porin BglH  57.22 
 
 		 538 aa  616  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2437  porin LamB type  56.84 
 
 		 545 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2740  porin LamB type  54.73 
 
 		 518 aa  592  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1736  glucoside specific outer membrane porin BglH-like protein  53.11 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1636  glucoside specific outer membrane porin BglH  52.75 
 
 		 557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  46.38 
 
 		 540 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  29.53 
 
 		 435 aa  156  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  28.94 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  27.8 
 
 		 435 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  27.05 
 
 		 447 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  29.63 
 
 		 416 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  27.12 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  26.9 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  26.67 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  26.67 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  24.95 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  23.78 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  23.78 
 
 		 446 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  23.78 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  23.78 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  23.78 
 
 		 446 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  23.78 
 
 		 446 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  23.78 
 
 		 446 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  23.78 
 
 		 446 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  26.77 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  26.77 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  26.77 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  23.19 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  23.33 
 
 		 452 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  23.65 
 
 		 452 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  23.33 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  23.65 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  23.33 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1666  porin, LamB family  56.86 
 
 		 51 aa  72.8  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  25.93 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  22.86 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0709  maltoporin precursor (outer membrane protein S)  23.2 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51510  sucrose porin  24.57 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1821  putative maltoporin  22.55 
 
 		 459 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2105  putative maltoporin  24.1 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.301881  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  22.76 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06946  hypothetical protein  31.37 
 
 		 432 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  23.53 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  22.52 
 
 		 531 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  22.43 
 
 		 463 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  26.9 
 
 		 538 aa  43.5  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>