15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0225 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0225  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.31889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3318  hypothetical protein  42.17 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0213  hypothetical protein  35.59 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04805  hypothetical protein  27.73 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3016  putative glycoporin  25.17 
 
 		 456 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2999  putative glycoporin  25.17 
 
 		 456 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.419579  hitchhiker  0.000157267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2964  putative glycoporin  25.17 
 
 		 456 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  hitchhiker  0.00105838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2933  putative glycoporin  25.17 
 
 		 456 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0271208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4204  hypothetical protein  26.15 
 
 		 469 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3383  glycoporin RafY  24.69 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3117  glycoporin RafY  24.69 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.303437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5352  glycoporin RafY  24.79 
 
 		 464 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03786  putative glycoporin  24.79 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4291  glycoporin RafY  24.22 
 
 		 464 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216775 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03735  hypothetical protein  24.79 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>