27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3090 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2199  hypothetical protein  59.68 
 
 		 531 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3090  hypothetical protein  100 
 
 		 538 aa  1108    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3128  hypothetical protein  51.17 
 
 		 562 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0776  hypothetical protein  47.61 
 
 		 587 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1033  hypothetical protein  51.11 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0974  hypothetical protein  52.16 
 
 		 488 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1036  hypothetical protein  51.96 
 
 		 488 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.823153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0760  hypothetical protein  46.86 
 
 		 592 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.554801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2218  hypothetical protein  56.18 
 
 		 575 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000179043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3633  hypothetical protein  56.35 
 
 		 589 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.832641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0483  hypothetical protein  29.55 
 
 		 574 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0459  hypothetical protein  29.23 
 
 		 574 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0478  hypothetical protein  29.39 
 
 		 574 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.486321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4143  hypothetical protein  29.07 
 
 		 574 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3512  hypothetical protein  29.24 
 
 		 576 aa  160  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3555  hypothetical protein  32.89 
 
 		 570 aa  160  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.688598  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0440  hypothetical protein  29.08 
 
 		 576 aa  160  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3689  hypothetical protein  29.08 
 
 		 576 aa  159  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4059  hypothetical protein  31.04 
 
 		 570 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3179  hypothetical protein  28.81 
 
 		 601 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0515  hypothetical protein  30.97 
 
 		 570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.363208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2269  hypothetical protein  26.39 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5229  hypothetical protein  22.61 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0780533  normal  0.270928 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1185  hypothetical protein  23.14 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1304  hypothetical protein  22.42 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  31.88 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  33.85 
 
 		 538 aa  44.3  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>