25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0483 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0483  hypothetical protein  100 
 
 
574 aa  1184    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4143  hypothetical protein  94.6 
 
 
574 aa  1135    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0478  hypothetical protein  99.83 
 
 
574 aa  1182    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.486321  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4059  hypothetical protein  83.62 
 
 
570 aa  1007    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3512  hypothetical protein  94.23 
 
 
576 aa  1125    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0440  hypothetical protein  94.58 
 
 
576 aa  1129    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3555  hypothetical protein  84.49 
 
 
570 aa  1012    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.688598  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3689  hypothetical protein  93.88 
 
 
576 aa  1123    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3179  hypothetical protein  73.23 
 
 
601 aa  914    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0515  hypothetical protein  85.02 
 
 
570 aa  1031    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.363208  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0459  hypothetical protein  98.78 
 
 
574 aa  1174    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0760  hypothetical protein  30.2 
 
 
592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.554801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0776  hypothetical protein  30 
 
 
587 aa  193  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2199  hypothetical protein  30.57 
 
 
531 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1033  hypothetical protein  29.53 
 
 
488 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1036  hypothetical protein  29.7 
 
 
488 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.823153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2218  hypothetical protein  30.17 
 
 
575 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000179043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3128  hypothetical protein  29.3 
 
 
562 aa  170  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3090  hypothetical protein  29.55 
 
 
538 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0974  hypothetical protein  29.32 
 
 
488 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3633  hypothetical protein  29.85 
 
 
589 aa  157  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.832641  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2269  hypothetical protein  28.97 
 
 
515 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1304  hypothetical protein  25.36 
 
 
476 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1185  hypothetical protein  24.46 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5229  hypothetical protein  25.51 
 
 
550 aa  70.1  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0780533  normal  0.270928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>