22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5229 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5229  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1103    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0780533  normal  0.270928 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0483  hypothetical protein  25.51 
 
 
574 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0478  hypothetical protein  25.51 
 
 
574 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.486321  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0459  hypothetical protein  25.33 
 
 
574 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4143  hypothetical protein  25.09 
 
 
574 aa  66.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3512  hypothetical protein  25.28 
 
 
576 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0440  hypothetical protein  25.28 
 
 
576 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3689  hypothetical protein  25.28 
 
 
576 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0515  hypothetical protein  24.14 
 
 
570 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.363208  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4059  hypothetical protein  26.99 
 
 
570 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3090  hypothetical protein  22.61 
 
 
538 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3179  hypothetical protein  25.96 
 
 
601 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3555  hypothetical protein  23.74 
 
 
570 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.688598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2199  hypothetical protein  24.06 
 
 
531 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2269  hypothetical protein  37.5 
 
 
515 aa  54.3  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0974  hypothetical protein  23.35 
 
 
488 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3128  hypothetical protein  34.72 
 
 
562 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2218  hypothetical protein  22.93 
 
 
575 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000179043  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1304  hypothetical protein  22.77 
 
 
476 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1185  hypothetical protein  25.14 
 
 
466 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1036  hypothetical protein  29.03 
 
 
488 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.823153  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1033  hypothetical protein  29.03 
 
 
488 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>