25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3555 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0483  hypothetical protein  84.49 
 
 		 574 aa  1012    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4143  hypothetical protein  84.15 
 
 		 574 aa  1010    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0478  hypothetical protein  84.67 
 
 		 574 aa  1014    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.486321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4059  hypothetical protein  80.18 
 
 		 570 aa  961    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3512  hypothetical protein  84.09 
 
 		 576 aa  1005    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0440  hypothetical protein  84.09 
 
 		 576 aa  1006    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3555  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1171    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.688598  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3689  hypothetical protein  83.57 
 
 		 576 aa  1002    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3179  hypothetical protein  72.71 
 
 		 601 aa  893    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0515  hypothetical protein  83.33 
 
 		 570 aa  1006    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.363208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0459  hypothetical protein  84.32 
 
 		 574 aa  1010    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0760  hypothetical protein  29.83 
 
 		 592 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.554801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0776  hypothetical protein  28.82 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2199  hypothetical protein  29.6 
 
 		 531 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1033  hypothetical protein  29.55 
 
 		 488 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3128  hypothetical protein  30.96 
 
 		 562 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1036  hypothetical protein  29.38 
 
 		 488 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.823153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2218  hypothetical protein  29.75 
 
 		 575 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000179043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3633  hypothetical protein  29.38 
 
 		 589 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.832641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3090  hypothetical protein  32.89 
 
 		 538 aa  160  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0974  hypothetical protein  28.33 
 
 		 488 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2269  hypothetical protein  28.54 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5229  hypothetical protein  23.74 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0780533  normal  0.270928 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1185  hypothetical protein  28.29 
 
 		 466 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1304  hypothetical protein  26.85 
 
 		 476 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>